隨著結(jié)核病防治研究的不斷深入, 人們發(fā)現(xiàn)細(xì)胞水平時代結(jié)核病流行病學(xué)的兩大問題———傳播途徑和傳染源, 是了解得不夠確切、不夠深刻的, 從傳染與發(fā)病的關(guān)系上鑒定外源性再感染, 用噬菌體分型毫無實際價值。而常規(guī)細(xì)菌培養(yǎng)法進行耐藥性監(jiān)測作為流行病學(xué)調(diào)查方式之一, 只能了解其耐藥的表型狀況, 難以探討其內(nèi)在機制。隨著分子生物學(xué)的飛速發(fā)展, 1980 年以后, 逐步建立了一些根據(jù)核酸序列進行菌株鑒定的高度特異的基因分型方法, 主要包括: 限制性片段長度多態(tài)性、DNA 指紋圖譜分析、脈沖場凝膠電泳、PCR酶切分型、隨機擴增多態(tài)性DNA、DNA 序列分析以及基因芯片技術(shù)等等。結(jié)合現(xiàn)代分子生物信息學(xué)技術(shù), 使結(jié)核分枝桿菌的菌株分型進入了一個全新的領(lǐng)域———株水平的鑒定, 也進而使結(jié)核病分子流行病學(xué)的研究取得了很大的進展。許多研究者在結(jié)核病的流行病學(xué)研究中, 把群體研究與個體研究、宏觀研究與微觀研究結(jié)合起來, 研究結(jié)核分枝桿菌( Mycobacteriumtuberculosis,MTB) 的分子結(jié)構(gòu)上的差異, 結(jié)合病例流行病學(xué)資料, 以闡明結(jié)核病的流行病學(xué)問題, 形成了結(jié)核病分子流行病學(xué)。分子分型技術(shù)是結(jié)核病分子流行病學(xué)研究的重要手段之一。對受感染個體的菌株進行分子分型在追蹤傳染源方面起重要作用。